NECTIN-4 PEPTIDE DISCOVERY PLATFORM
Nectin-4靶向多肽发现与PDC设计
汇集已知靶向肽、结构–活性关系、PDC组成与候选设计数据,支持序列检索、证据溯源、模型研判和优先级筛选。
TARGET / NECTIN-4 · PVRL4
Peptide discovery, from evidence to design.
围绕Nectin-4结合肽构建可检索的序列、骨架、活性和证据体系,并将强化学习候选生成、结构约束和多目标排序纳入同一研发工作流。
候选肽结合路径NECTIN-4 D1 / 6C TRICYCLIC PEPTIDE
9已知多肽
31实验记录
67生物活性记录
1,300外部背景序列
5,000在线候选
1.05 M候选设计空间
从已知序列和证据出发,连接结构规律、候选生成与优先级评估。
覆盖多肽实体、候选库、PDC组件、实验活性、文献专利及结构计算记录。
INFORMATION ARCHITECTURE
三层数据架构
实体核心、候选设计与证据决策三层协同,支持检索、关联和数据更新。
LAYER 01
经整理的实体核心
- 多肽、骨架、环化与非天然残基
- 连接子、载荷与PDC组合
- 实验、生物活性、文献与专利
→
LAYER 02
候选与SAR仓
- BT8009系列58条SAR记录
- 33个三环假设与多骨架Top 5000
- 1.05百万候选设计空间
→
LAYER 03
证据与决策层
- E1–E6证据等级与核验状态
- 候选—母核对照与计算记录
- 搜索、筛选、下载和API接口
ADVANCED SEARCH
全库检索
支持主题、编号、序列、骨架、来源等字段组合检索,并可通过“与、或、非”构建检索式。
检索提示可直接使用主题检索;需要限定字段、资源类型或证据等级时,展开“高级检索”。
PEPTIDE ENTITIES
多肽实体库
区分已知Nectin-4结合肽、正向种子、外部肿瘤归巢肽背景序列,以及按“6C→3二硫键→3环”定义构建的三环候选。
REINFORCEMENT LEARNING / DECISION AI
强化学习候选设计模型
模型在单链、双环和三环三类骨架空间中学习骨架选择、残基组合、环拓扑和开发手柄策略,并以亲和、稳定性、溶解性、合成可行性与PDC兼容性构成多目标奖励。
TRAINING80策略更新轮次
ACTION SPACE61含3类骨架动作
OBJECTIVES5多目标奖励维度
SCAFFOLDS3单链 / 双环 / 三环
MODEL ARCHITECTURE
候选生成与策略更新
点击任一步骤,查看该阶段的输入、约束和输出。
→
→
→
→
→
LIVE RANKING
权重驱动的动态Top 10
拖动权重后,候选顺序立即更新;点击条目查看完整序列与拓扑。
CANDIDATE WAREHOUSE
Top 5000 · 多骨架候选库
候选库同时收录单链、双环和三环结构,并在统一指标体系下比较亲和、稳定性、溶解性、合成可行性与PDC兼容性。
横轴:合成可行性;纵轴:亲和代理。颜色区分单链、双环和三环候选;点击数据点打开条目详情。
SCAFFOLD COMPARISON
骨架综合比较
Top 100均值比较三类骨架Top 100候选的综合奖励、亲和、稳定性与合成可行性。
选择骨架后,环化方式和拓扑筛选会自动匹配;点击任一行查看完整候选信息。
| RANK / ID | 骨架 / 环数 | 母核 / 手柄 | 序列 | 环化方式 / 拓扑 | 亲和代理 | 稳定性 | 溶解性 | 合成可行性 | PDC兼容性 | 总体奖励 |
|---|
SCAFFOLD & SAR
骨架、环化与结构–活性关系
将骨架本体、环闭合位点、BT8009系列SAR记录、专利序列变体和设计规则分开管理,避免把“骨架优势”简化为单一综合分。
共12条,连接肽实体、环编号、位点范围、闭合类型和环化连接子。
保留化合物、母体、位点变化、实验指标、数值、单位、来源表格和解释。
PDC COMPONENTS
连接子、载荷与PDC组合
PDC不是单一条目,而是“靶向肽 × 连接子 × 载荷 × 偶联位点 × 释放机制”的组合实体。平台保留每一层组件及其来源。
靶向肽Peptide
已知Nectin-4结合肽、序列、骨架、环化和开发手柄。
+
连接子Linker
环化连接子或PDC连接子,记录裂解模式、键型、触发条件和连接基团。
+
载荷Payload
细胞毒或成像载荷,记录机制、应用、偶联手柄和开发状态。
EVIDENCE GRAPH
实验、活性与来源证据
同一数值必须连接到实验记录、来源位置、文献或专利、证据等级及核验状态。平台不以来源标题代替数据出处。
E3 专利/生物物理E4 细胞E5 体内/组合E1 代理候选MS 方法学模拟
STRUCTURAL COMPUTATION
跨骨架筛选后的10个优选三环候选与对照记录
Top 5000先在单链、双环和三环之间进行统一排名;综合代理比较后,入选本轮结构计算的10个优先候选均为三环结构,并与其双环母核进行成对对照。
STABILITY
当前配对3×100 ns RMSD
方法学模拟 · Å
三环候选同时显示代理优势、模拟计算表现、合成可行性和合成复杂度,不设为所有指标绝对最优。
| 配对 | 候选 | 母核 | 第三环 | 候选MM/GBSA | 母核MM/GBSA | 候选RMSD | 合成可行性 | 合成复杂度 | 研判 |
|---|
DATA DOWNLOAD
数据下载
按研究用途下载公开展示数据。数据字段、证据等级和来源信息与网页条目保持一致。
CSV格式可直接用于Excel、R、Python及后续统计分析。
已知肽Nectin-4已知靶向肽
包含序列、骨架、环数、结合方法、活性数值和证据等级。
下载CSV →
候选库Top 5000多骨架候选
包含单链、双环和三环候选及统一多目标评分。
下载CSV →
骨架比较单链、双环与三环比较
汇总不同骨架的候选数量、Top区间表现和开发性指标。
下载CSV →
PDCPDC组合数据
包含靶向肽、连接子、载荷、偶联位点和释放机制。
下载CSV →
SARBT8009结构–活性关系
包含化合物、位点变化、实验指标、数值和来源位置。
下载CSV →
生物活性实验与活性记录
包含实验终点、数值、单位、模型系统、来源和证据等级。
下载CSV →